从运动医学的角度来分析，主要有下列几种原因：
内脏适应障碍：
由于惯性作用，当人体由安静状态立即进入剧烈运动时，虽然神经肌肉系统立即处于高度兴奋状态，但呼吸循环、消化、内分泌等系统需要一定的时间才能适应剧烈运动的需要。此时，人体各系统的配合，可能发生脱节而导致功能紊乱。
内脏重力牵拉作用：
当身体运动剧烈时，脏器在腹内的活动度也增大，必然牵拉系膜(特别是胃肠部由系膜、韧带固定于腹后壁)。分布于系膜中或附近的神经、血管受到牵拉并超过其耐受限度时，即可引起内脏神经功能紊乱，产生腹痛恶心等症状。在饱食后立即参加剧烈运动，最易发生此种症状。此外，在运动时由于重力因素，小肠内容物坠积于回盲部，该处神经、血管受到牵张，可发生右下腹胀痛。
胃肠缺血或饥饿性痉挛：
肌肉运动的能量主要靠肌糖原氧化供给，剧烈运动时，能量的消耗比安静时可多10倍。饥饿时血糖浓度本身就偏低，再做剧烈运动，更易出现低血糖，并发生心悸、冷汗及饥饿性腹痛等。同时，胃肠道容易发生缺血性痉挛和功能紊乱。
内脏扭转：
由于运动时内脏移动度增大，一些处于病态(如胃下垂、肠蛔虫团、游走肾脾及卵巢囊肿、肠系膜肿瘤等)下的脏器有时可发生扭转。这种腹痛成因在缺乏锻炼或不按计划锻炼的人中发生较多。
预防运动时腹痛的发生，应避免精神紧张，充分做好准备活动，注意循序渐进加大运动量，量力而行。此外，剧烈运动前，既不要吃得过饱，不要吃平时不习惯的食物，也不要饿着肚子参加运动，一般在饭后1小时后再进行运动为好。
腹痛的紧急处理：
◆放慢运动速度，减少运动量。一般不要突然停下来，完全静止休息;
◆轻轻按摩和揉动腹部，可以起到顺畅血脉和减轻疼痛刺激的作用;
◆深呼吸可增加氧气的吸入量、调节心肺功能，也可减轻腹肌的紧张，缓解腹痛;
◆用手指分别用力按压两前臂的“内关”穴，有助于止痛：伸臂，仰掌，在前臂内侧中间，腕后第二横纹上三横指，两根筋的中间;
◆若有心悸、冷汗、昏迷、脉弱等体征，应立即平躺，并喝一些糖水;
◆可口服阿托品、普鲁本辛等药物解痉止痛;
◆如腹痛顽固，剧烈难忍，应及时到医院检查。